A FMH tem atualmente nove laboratórios centrados na área científica da Motricidade Humana, que visa o estudo dos fenómenos associados à compreensão aprofundada dos processos de produção e dos efeitos do movimento humano, numa perspetiva biopsicossocial.
Estes institutos interdisciplinares estão alinhados com a tradição de longa data da FMH de cruzar fronteiras para lidar com grandes problemas, envolvendo professores e alunos em colaborações que vão desde estudos internacionais até desafios enfrentados pela saúde e pelo bem-estar físico.